docs: record approved Omics GitHub to PSD relay handoff

docs/operations/shell-and-localization.md

@@ -170,6 +170,44 @@ CSS esistente con i token light/dark; non mescolarlo con la nuova Theming API di
 
 ## Verifica prima del deploy server
 
+### Acquisire prima le modifiche al repository Omics
+
+Procedura concordata il 13 settembre 2026: **Mac → GitHub → server → Gitea PSD**.
+Il Mac pubblica il branch Omics `codex/thothii-embedded-shell` su
+`https://github.com/Dallavilla-Tiziano/omics_portal.git`; l'operatore lo recupera
+dal server e lo pubblica su `ssh://git@localhost:2222/aritmolab/omics_portal.git`.
+Il secondo passaggio è un **push** a Gitea, non un pull. Questa scelta evita di
+richiedere al Mac credenziali Gitea PSD. Non cambia l'origine Gitea TYL di ThothII.
+
+Consegna GitHub verificata il 13 settembre 2026:
+`fca10901a73666ca257d8f4cc4b77066295c400a`, che include il commit funzionale
+`95154e1` e la guida per il server. Per questa consegna lo SHA acquisito sul
+server deve coincidere esattamente. Eventuali consegne successive richiedono un
+nuovo SHA comunicato e approvato, non l'accettazione implicita della testa del branch.
+
+I comandi completi sono nella
+[guida del repository Omics](https://github.com/Dallavilla-Tiziano/omics_portal/blob/codex/thothii-embedded-shell/docs/thothii-integration.md#consegna-via-github-e-pubblicazione-su-gitea-psd).
+Sul server, per recuperare il branch e leggere la guida senza cambiare i file
+del portale in esecuzione:
+
+```bash
+cd /home/chirone/omics_portal
+git status --short --branch
+git fetch --no-tags https://github.com/Dallavilla-Tiziano/omics_portal.git \
+  refs/heads/codex/thothii-embedded-shell:refs/remotes/github-relay/codex/thothii-embedded-shell
+git rev-parse refs/remotes/github-relay/codex/thothii-embedded-shell
+git show refs/remotes/github-relay/codex/thothii-embedded-shell:docs/thothii-integration.md
+```
+
+Confrontare lo SHA con la consegna dal Mac prima di procedere con il push
+documentato nella guida. Non usare `git pull` nel checkout condiviso né
+`git push origin`: quest'ultimo può avere due destinazioni. Non cambiare
+`master` o riavviare Omics durante il trasferimento. L'integrazione e il deploy
+richiedono una successiva approvazione, con revisione/immagini di rollback
+registrate e rilascio coordinato con ThothII embedded/upstream.
+
+### Accettazione dell'integrazione
+
 Provare l'apertura dal menu Omics con un utente autorizzato e uno senza accesso;
 verificare assenza di un secondo login e di header ThothII, italiano/inglese già
 selezionati prima dell'apertura, tema, fullscreen e uscita con Esc. Ripetere con